VISI: Menjadi komunitas akademik, pencerah budi dan hati, pembentuk calon pemimpin Gereja dan dunia. 
MISI: Menghasilkan lulusan yang unggul dalam ilmu filsafat-teologi dan prinsip-prinsip fundamental tata hidup bersama.

Tujuan

1. Menghasilkan lulusan dengan integritas kemampuan yang unggul dalam ilmunya dan dalam kepemimpinan yang melayani kepada umat Katolik dan masyarakat pada umumnya;
2. Mewujudkan program-program studi yang unggul dengan kreatif menghasilkan publikasi dan kontribusi karya filosofis teologis dalam bidang-bidang: 
   a) filsafat-teologi kontekstual, dialog interreligius, teologi pewartaan (Kitab Suci),
   b) teologi praktis: pastoral, katekese, pemberdayaan dan pembangunan Jemaat pinggiran atau yang tersisihkan (theologizing from the margins), 
   c) teologi spiritualitas untuk pengembangan Jemaat, tarekat, atau kongregasi, dan 
   d) berteologi lintas kultural (penggalian local wisdom dan kaitannya dengan berteologi), teologi sosio-politik, teologi inkulturatif, dan “teologi publik”.

Sasaran

Terciptanya sistem pendidikan program studi filsafat teologi yang unggul dengan karakter karakter yang telah ditulis dalam visi misi prodi masing-masing. Dihasilkannya lulusan untuk para doktor teologi yang memiliki kemampuan mumpuni dalam bidang ilmunya level 9 KKNI; para magister level 8; dan sarjana level 6. Terwujudnya program studi sebagai pengembangan disiplin ilmu filsafat teologi yang bermutu, relevan, dan aktual. Tercapainya keselarasan yang nyata antara kurikulum program studi filsafat teologi dan “outputs” yang unggul. Diwujudkannya kontribusi karya-karya filosofis teologis dengan metodologi mutakhir dan kontekstual untuk menjawabi kebutuhan Gereja, dunia, dan masyarakat.